历史沿革:中国科学院上海应用物理研究所是2003年6月经国家批准设立的，专业从事民用非动力核技术科学研究的国立研究所。坐落于上海市科技卫星城嘉定区，古地面积400亩。以同步辐射、自由电子激光、离子束等加速器物理和技术，探测与成像物理和技术，同位素、标记化合物及辐照装置与辐照新材料科学与技术等民用非动力核技术科学的基础研究、应用研究及其相关交叉、边缘学科研究为主;同时积极推进民用非动力核技术科学研究成果的产业化。中国科学院上海应用物理研究所是中国科学院知识创新工程试点全面推进阶段的试点单位。其前身是成立于1959年的中国科学院上海原子核研究所。

　　人员状况：截止2003年底，上海应用物理所共有在职职工689人，其中科技人员478人，创新试点基地内人员269人，中国科学院院士1人，973项目首席科学家1名、副首席科学家1名，研究员级科技人员51人，副研究员级科技人员98人。设有粒子物理与原子核物理、核技术及应用、无机化学博士、硕士学位培养点，及物理学博士后流动站。共计在学研究生170人，其中博士生73人，硕士生97人;另有博士后7人。

　　机构设置和学科方向：研究所机构设置为大科学工程技术部、基础研究室、应用研究中心、技术支撑部门、管理部门、科技企业六大类，并建有“中国科学院核分析技术重点实验室”、“上海市低温超导高频腔技术重点实验室”，上海光源工程经理部负责国家大科学工程“上海光源”——第三代同步辐射装置的研制和建设。主要学科方向包括：先进光源（同步辐射与自由电子激光）和束线的科学与技术研究，先进离子束的科学与技术研究，核物理实验和理论研究，基于核技术与纳米技术的交叉与边缘科学研究，放射性药物研究，辐射改性新材料研究，应用加速器的研制及先进探测技术研究等。

　　正在研究的重大项目：承担着国家大科学工程、973、863、自然科学基金和中国科学院重大重点项目，如:上海光源工程，973项目“放射性核束物理与核天体物理”、“X射线自由电子激光(FEL)前期研究”，中科院创新重大项目“核技术应用的关键技术”，中科院创新重要方向性项目“微束在团簇中的输运机制及相关效应的研究”。“先进核分忻技术在环境科学中的应用研究"等。

　　突出成果:截止2003年底，取得科研成果600余项，获各类科技奖项162项，其中国家科技进步奖5项、国家自然科学奖4项。“重离子核反应的集体效应、奇异核产生及其性质研究”、“重质量丰中子新核素的合成鉴别和研究”获国家自然科学二等奖。

　　学术刊物:《核技术》《核科学与技术(英文版)》《辐射研究和辐射工艺学报》。上海市原子核学会挂靠上海应用物理所;从2004年起，中国物理学会同步辐射专业委员会挂靠上海应用物理所。

　　交流与合作:围绕光源技术和自由电子激光技术的合作与交流，已与日本Spring-8、意大利ELETTRA、韩国PLS签订了所级合作协议，与日本KEK国家实验室共同执行了据点大学合作协议，与法国ESRF、德国BESSY-II等机构确立合作与交流关系；加入了RICH-STAR国际合作计划(项目);与中科院高能物理所建立了所级合作关系。

　　科技成果转化:经过三十多年的积累，上海应用物理所已形成较强的技术开发能力，尤其在特种仪表、辐射技术、放射性同位素技术等方面具有很强的优势。以所研究开发的技术为依托，所控股与参股科技企业年销售值近亿元，利润超千万。