1999年开始，由市妇联会同市教委、市科委、市人事局（2003年加入）每二年一次以科教系统为主开展“巾帼创新奖”的评选活动。评委由24位院士、专家组成，叶淑华院士担任评委会主任。至今已连续评选三届，共有15人获得“上海市巾帼创新奖”，14人获得“上海市巾帼创新奖”提名奖，并在“三八”节庆祝大会上予以表彰。
　　
　　2004年3月，在全市“三八”节纪念大会上表彰了第三届“上海市巾帼创新奖”获得者：陈楠（上海第二医科大学附属瑞金医院肾脏内科主任、医学博士）、胡安康（中国船舶工业第七O八研究所所长、研究员、博士）、黄淑帧（上海市儿童医院医学遗传研究所研究员、研究室主任）、黄丹枫（上海交通大学农业与生物学院副院长、教授、博士生导师）、郭青（上海市建筑科学研究院新型建材工程技术研究所二室主任、高级工程师）等五位同志荣获第三届“上海市巾帼创新奖”；范秀敏（上海交通大学机械制造及自动化研究所副所长、教授、工学博士）、赵爱华（上海市环境工程设计科学研究院院长、高级工程师）、贾伟平（上海市第六人民医院副院长、教授、主任医师）、何红（中国科学院上海光学精密机械研究所研究员、硕士）、王雁（中国船舶重工集团公司第七O四研究所国防扭矩计量专业站副主任、高级工程师）等五位同志荣获第三届“上海市巾帼创新奖提名奖”。同时，上海市妇联授予以上10位同志上海市“三八红旗手标兵”称号。