2008年是两岸经济关系发展史上具有重要意义的一年，随着马英九、萧万长在台湾的胜选，国民党重新回到台湾的执政舞台，两岸有望在“九二共识”基础上进入和平发展的新时期，两岸经济关系也有望进入一个全面合作交流的新阶段，这将开创两岸经济合作的全新格局。具体而言，两岸经济关系有望在以下五个方面有进一步密切发展的趋势。

　　（一）两岸大企业合作谋求全球产业制高点：近年来，台湾大企业进入大陆的速度在加快为未来两岸大企业全面加强产业合作提供了条件。台湾当局即将调整企业40%大陆投资的限制，代之以更为宽松的政策，这无疑从法律上也消除了两岸企业加强产业合作的障碍。未来两岸大企业应优势互补，以谋求产业制高点为目标，进行全面的产业战略合作。

　　（二）加强两岸的科技合作提升两岸产业创新能力：大陆“十一五”规划将增强自主创新能力作为重要内容，强调要加快建设国家创新体系，建设创新型国家，让“自主创新、自有品牌”成为企业壮大的动力。而台湾当局也在多项产业规划报告中提出要使台湾经济增长由劳动、资本投入为主，转型为以创新、研发投入为主导的发展模式，产业发展由重视资本积累转为重视附加价值提升。技术创新已成为两岸产业界的共同需求。两岸未来可共同组建产业技术发展基金，共同投资两岸有产业发展前景的创新技术，两岸的科研机构也可共组技术研发平台，共同研发，共享技术和市场利益。

　　（三）推动两岸金融合作为两岸经济合作引入活水：两岸金融合作一直是两岸经济关系中最薄弱的一环，两岸金融关系是伴随两岸经济关系共同发展的，随着两岸经济合作正在进入一个新的发展阶段，两岸金融合作也面临着新的发展机遇，推动两岸金融合作将为两岸经济合作引入活水。目前大陆地区的台资企业正面临着进一步向资本技术密集型企业转型的趋势，其对两岸金融服务的需求进一步扩大，如果两岸加强金融合作，必将增强台商转型的积极性和主动性，从而推动台资企业更长远地在大陆发展。

　　（四）两岸有望在区域经济范畴内加强合作：马英九在其竞选纲领中，把台湾经济振兴的希望放在扩大台湾经济的国际活动空间上。而由于中国大陆在区域和全球经济体系中地位的迅速上升，台湾经济向外拓展活动空间必须经过中国大陆这一桥梁，中国大陆已成为台湾走向世界的必经之途，两岸经济关系的密切，将有助于台湾经济进一步拓展活动空间。

　　（五）两岸经济合作机制建设将成为两岸经济关系发展的主轴：随着两岸政治关系缓和，建立两岸经济合作机制被再次提上议事日程，两岸经济合作机制有一个不断成长和完善的过程。两岸要以两岸资本运作和整合两岸优势资源为基础，以两岸产业合作、科技合作、金融合作为支柱，以共同打造两岸国际竞争力，促进两岸经济整合为目标，推进整个两岸经济全面合作体系的构建。就架构而言，两岸经济合作机制应是一个多层次体系，在最高层由主管部门授权海协、海基两会就两岸经济合作的重大政策和法律安排进行协商，而具体的产业合作机制则由两岸行业协会进行对口协商，除了两会谈判和行业协商外，两岸也可选择台商集中的特定地区进行两岸经济合作机制的试点，为全面推动两岸经济合作机制建设提供经验。