根据《农业部关于发布第五轮农业部重点开放实验室建设名单的通知》农科教发〔2008〕3号文，依托中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所（以下简称渔机所）的“农业部渔业装备与工程重点开放实验室” （农业装备与信息技术类）列入了第五轮农业部重点开放实验室建设名单。该实验室主要由依托于渔机所的“中国水产科学研究院渔业水体净化技术与系统研究重点开放实验室”与依托于中国水产科学研究院南海水产研究所的“广东省渔业生态环境重点实验室”联合，并吸收依托于渔机所的国家渔业机械仪器质检中心, 渔机所“检测实验室”、“海洋渔业装备性能研究实验室”、“水产品加工设备功能实验室”和依托于中国水产科学研究院黄海水产研究所的“渔业工程实验室”，以及中国水产科学研究院渔业工程研究所的专业特长等有关力量整合而成。

　　本次重点开放实验室的评估命名工作是为加强农业研究基地建设，提升农业科技自主创新能力，为现代农业和社会主义新农村建设提供强有力的科技支撑。“农业部渔业装备与工程重点开放实验室”的成功命名，将有力推动水科院渔业装备与工程学科的建设，为进一步提升其科技创新能力提供有力的保障。同时，对于加强院内相关科研力量的合作，共同推动我国渔业装备与工程的科技进步，促进我国渔业现代化发展起到重要作用。